Лесные мышовки крайне чувствительны к колебаниям температуры воздуха, особенно к ее понижениям, даже в период бодрствования. Весной и осенью при низких ночных температурах они нередко не покидают своих гнезд в течение суток, впадая в оцепенение, проходящее с потеплением. В таком состоянии часто обнаруживают зверьков в ловушках рано утром. Однако они очень быстро согреваются в руках, становятся активными, причем полностью повторяется только что описанная картина пробуждения от зимней спячки. Вследствие несовершенной терморегуляции, лесные мышовки, казалось бы, должны избегать холодного времени суток, однако наиболее деятельны они именно в сумерки или ночью. Правда, активность у них заметно меняется по сезонам, так что весной и осенью, особенно в северных частях ареала, она смещается на светлые часы суток, и зверьков часто удается наблюдать днем. Осенью они, как правило, покидают убежище за три часа до захода солнца и возвращаются к часу ночи. По наблюдениям в неволе, зверьки активны в течение трех-четырех часов, а остальное время проводят в убежище. Подвижность их резко возрастает в дождливые ночи, возможно потому, что в плохую погоду приходится тратить больше времени на поиск насекомых — излюбленного корма.

Лесную мышовку от других грызунов отличает удивительная, если так можно выразиться, миролюбивость. Вынутый из ловушки зверек не делает попыток кусаться, спокойно сидит на руке и занимается своим туалетом. Несколько мышовок, посаженных в одну клетку, легко уживаются друг с другом, нередко занимая один домик. Правда, в сколько-нибудь большой группе животных обычно выделяется одна особь, занимающая главенствующее положение, чаще всего такая роль принадлежит старой самке. Обнаружить ее среди других зверьков очень легко по поведению — она отнимает у них корм, кусает за хвост и уши, отгоняет от кормушки.

Настроение лесных мышовок легко угадать по положению хвоста, который у них служит четким выразителем эмоций. Возбужденные животные держат его почти вертикально. Такое же положение занимает хвост у самки, выгоняющей перед родами из гнезда самца. Встревоженные, настораживающиеся зверьки приподнимают хвост над полом, причем сами мелко-мелко дрожат и стучат зубами («точат зубы»). В спокойном состоянии и при кормежке грызуны опираются на хвост, а лазая, обвивают им ветку.